EXPOSOME (Contact S. DAGNINO)
L'exposome est un concept relativement nouveau qui vise à comprendre et à mesurer l'ensemble des expositions environnementales auxquelles un individu est soumis tout au long de sa vie. Il englobe les facteurs externes auxquels un individu est exposé, y compris les agents chimiques, physiques et biologiques, les facteurs psychosociaux et socio-économiques ainsi que les facteurs internes (stress oxydatif, mutations, inflammation etc.). Contrairement au génome, qui est fixe, l'exposome est dynamique et change continuellement au fur et à mesure qu'une personne interagit avec son environnement.
Notre équipe développe un axe de recherche Exposome et omics. Notre recherche vise à caractériser l’impact des expositions environnementales et du mode de vie sur la santé humaine pour élucider les mécanismes moléculaires reliant exposition et apparition des maladies. Notre approche s’appuie sur la combinaison de diverses méthodologies combinant le développement et l’utilisation de technologies Omiques de haute résolution telles que la métabolomique, la protéomique et l’adductomique et le l’exploration de nouvelles méthodes computationnelles basées sur les statistiques et l’intelligence artificielle (IA) afin de les interpréter.
Nous déclinons cette méthodologie a travers trois projets principaux :
L’Exposome de la thyroïde
La thyroïde est un organe particulièrement sensible à des expositions à des polluants. Notre équipe possède une expertise assez unique de détection très sensible d’effets perturbateurs thyroïdiens à la fois in vitro (modèles cellulaires appropriés, test radioactifs, protéomique et métabolomique) et in vivo (imagerie SPECT du petit animal, omics…). Cet aspect a été développé dans le projet Metarisk soutenue par l’IDEX Jedi (T. Pourcher, S. Lindenthal). Il est également développé aujourd’hui dans le cadre d’une collaboration avec Bayer.
L’Exposome et Cancer
L’Exposome et Cancer en combinant données d’exposition et multi-omiques nous travaillons sur des cohortes de patients de cancer du sein (C. Bailleux), poumon (S.Dagnino, O.Humbert) et ORL (G. D’Andrea) afin d’identifier des marqueurs moléculaires de carcinogenèse précoce et de réponse au traitement. Le projet EXPOL (PNR-ANSES 2023), nous permet d’explorer les facteurs de risque du cancer du poumon chez la femme non-fumeuse. A travers notre participation au projet EXPANSE (Horizon 2020) nous explorons les signatures prospectives multi-omiques du cancer du poumon.
L’Exposome et Vieillissement
L’Exposome et Vieillissement nous avons initié un projet qui consiste à utiliser les omiques pour produire des informations moléculaires sur les effets du healthy aging chez la personne âgée. Ce projet, visant à recruter plus de 10 000 personnes âgées de la région des Alpes-Maritimes, permettra de combiner des données environnementales et omiques. Ce projet est mené par Raphaël Zory (LAMHESS), Emeline Michel (gériatre CHU), Frédéric Parte (gériatre CHU), Olivier Guerin (gériatre CHU), et porté au sein de l’équipe per Thierry Pourcher et Sonia Dagnino.
Publications de Sonia Dagnino précédant son recrutement dans l'équipe
Epigenetic mechanisms of lung carcinogenesis involve differentially methylated CpG sites beyond those associated with smoking. Petrovic D. , Bodinier B. , Dagnino S., Whitaker M., Karimi M., Campanella G., Nøst T.H., Polidoro S., Palli D., Krogh V., Tumino R., Sacerdote C., Panico S., Lund E., Milne R., Dugué P.A., Giles G., Severi G., Southey M., Vineis P., Stringhini S., Bochud M., Sandanger T.M., Vermeulen R., Guida F., Chadeau-Hyam M. European Journal of Epidemiology, accepted, 37 (6), 629-640.
Prospective Identification of Elevated Circulating CDCP1 in Patients Years before Onset of Lung Cancer Proteins and Transcripts in Prospective Lung Cancer Cases, Dagnino S. Bodinier B. Guida F. , Smith-Byrne K., Whitaker MD, Haugdahl Nøst T., Agnoli C., Palli D., Sacerdote C., Panico S., Tumino R., Schulze M.B., Johansson M., Keski-Rahkonen P., Scalbert A., Vineis P., Johansson M., Sandanger TM, Vermeulen RCH, Chadeau-Hyam M.. Cancer Research, 81 (13), 3738-3748.
Agnostic Cys34-albumin adductomics and DNA methylation: implication of N-acetylcysteine in lung carcinogenesis years before diagnosis. Dagnino S., Bodinier B., Grigoryan H., Rappaport S.M., Karimi M., Guida F., Polidoro S., Edmands W.B., Naccarati A, Fiorito G., Sacerdote C., Krogh V., Vermeulen R., Vineis P., Chadeau-Hyam M. International Journal of Cancer, 146, 3294-3303 (2020).
What’s new in the Exposome? Vineis P., Robinson O., Chadeau-Hyam M, Dehghan A., Mudway I., Dagnino S. Environment International, 143, 105887 (2020).
